分子シミュレーション実行時のクーロンポテンシャルの効率的な計算法：Ewald法とParticle Mesh Ewald法【理論化学、計算化学】

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分子シミュレーションのための分子間力場の評価方法【計算化学、理論化学】

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計算化学でデザインする人工酵素【生物化学、計算化学】

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【計算化学】分子の相互作用(６): エワルド法の基礎 〜長距離クーロン相互作用の取り扱い〜

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【計算化学】分子の相互作用(７): エワルド法の導出〜クーロン相互作用の長距離成分を計算する〜

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【計算化学】分子の相互作用(4)： レナード-ジョーンズ・ポテンシャルからバッキンガム・ポテンシャルまで

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アンブレラサンプリング法を用いた自由エネルギーの算出【計算化学、理論化学】

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高分子シミュレーションにおける粗視化モデルの役割

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こどもの『ｺﾐｭﾆｹｰｼｮﾝ革命』が起こる！たった一つの方法。

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MD法

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分子シミュレーションで用いられる温度制御法：速度スケーリング法とベレンゼン法【計算化学、理論化学】

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時間発展演算子法による分子シミュレーション：リウビル演算子の導入【理論化学、計算化学】

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分子動力学シミュレーションで用いられる長距離相互作用の計算法：多重極展開法【計算化学、理論化学】

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生体分子の揺らぎを観測・解析する方法【生物化学、計算化学】

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分子力学法を用いた分子動力学シミュレーション研究【理論化学、計算化学】

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分子のシミュレーションによる自由エネルギー計算法：熱力学的積分法と自由エネルギー摂動法【計算化学、理論化学】

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Car–Parrinello分子動力学(CPMD)法: 溶媒効果の考慮【量子化学、計算化学】

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Molecular Simulations

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